Savaşta kaybedilen birçok önemli insan ile birlikte, Dünya Federasyon Hükûmeti''nin yeniden inşa etmek için seferber olunmuş ve Birleştirilmiş Koloniler başkanı Brian Midcrid ise bu hükûmet''in başına geçmiştir. Federasyon rejiminin kritik bir döneminde, halka uzaylıların var olduklarını açıklamış ve “Tokyo Deklarasyonu” olarak bilinen L5 Savaşına neden olmuştu. Aerogator denilen uzaylı türle yapılan L5 savaşının üzerinden altı ay geçmeden DC bölüğünün kalıntıları ve diğer askeri takımlar liderliği almak için yarışmaya baslar. Henüz uzaylı tehlikesi geçmeden çıkan bu krizi çözmeye umudu olanlar sadece Hagane ve Hiryuu Kai''nin takimidir.