Ağustos 20xx’te Ginza/Tokyo’da “Gate” olarak bilinen paralel dünyaya aniden bir geçit ortaya çıktı. Geçitten fışkıran canavarlar ve birlikler yüzünden alışveriş bölgesi kan gölüne döndü. Japon Kara Savunma Kuvvetleri olaya hemen müdahale ederek, yaratıkları geçide doğru geri püskürttü. Müzakereleri kolaylaştırmak ve gelecekte olacak savaşlara hazırlık yapmak için JGSDF Üçüncü Keşif Ekibini geçidin öteki tarafında ki “Özerk Bölge” ‘ye gönderdi. 33 Yaşındaki Otaku ve JSDF memuru Itami Youji, ekibin lideri olarak atandı. Birçok yere uğrayıp, yerel halk ve coğrafya hakkında bilgi toplayan ekibe Amid saldırır. Aniden ortaya çıkan ve bilinmeyen bir dünyaya açılan bu geçit ile büyük güçlerin sadece yardımcı olabileceği bir ortamda, kahramanımız geniş bilgisi, arkadaşlığı ve farklı bakış açısı ile bu iki dünya arasındaki barışı sağlayabilecek mi?